Digital signierte Dateien können genauso bearbeitet und geändert werden, wie nicht signierte Dateien, es wird nur die Änderung sichtbar gemacht.
Bei manchen Programmen erscheint bei Änderung einer Datei eine Fehlermeldung (wie „Signatur gültig, Datei verändert“), bei anderen Programmen werden Änderungen archiviert es kann die zu jeder Unterschrift gültige Dateiversion abgerufen werden. Dies ist besonders bei komplexen Verträgen von Vorteil, die von einzelnen Vertragsparteien nur teilweise oder mit Vorbehalten unterschrieben werden.